重构结果

CryoGEN / CryoWGEN 在真实生物数据集上的重构结果与关键指标。

前面几页讲的是方法本身——把缺失楔形修复奠基为贝叶斯反问题、再用统计机器学习求解。这一页换个角度,汇总这些方法实际跑出来的结果:在真实 cryo-ET 数据上做了什么、好在哪里。(细节与完整图表见论文 [1][2]。)

更接近真实结构 —— 明显优于 IsoNet、DeepDeWedge
补回缺失楔形抹掉的信息
无需任何真值标签
更快训练,用时显著更少

在真实数据上验证

CryoGEN 在多个真实生物数据集上做过验证,包括未成熟 HIV-1 病毒颗粒核糖体。它把每张被噪声和缺失楔形破坏的断层图,重构成更各向同性、结构更完整的三维体,而且全程无需真值标签

关键结果图

WBP 重构的 apoferritinWBP(含伪影)
IsoNet 重构的 apoferritinIsoNet
CryoGEN 重构的 apoferritinCryoGEN
apoferritin(PDB 6Z6U)低密度体的重构对比。WBP 留下缺失楔形伪影(沿竖直方向的拖尾与缺口),IsoNet 仍有不一致,CryoGEN 给出更光滑、更完整的结构。图取自 CryoGEN(ICLR 2025)Figure 7。
Vipp1 堆叠环的三维重构对比
C13 Vipp1 堆叠环(EMDB:18424)的三维重构对比:(a) WBP 重构 →(b) IsoNet →(c) CryoGEN(本文)→(d) 真实结构。WBP 与 IsoNet 留下伪影,CryoGEN 的结果最接近真实结构。图取自 CryoGEN(ICLR 2025)Figure 2。

定量对比

在带已知真值的合成数据(球形、棱柱、Vipp1 装配体)上,CryoGEN 在 PSNR 与 SSIM 上都明显优于基线(数值越高越好):

数据状态球形 PSNR球形 SSIM棱柱 PSNR棱柱 SSIMVipp1 PSNRVipp1 SSIM
退化21.120.811314.820.693126.680.8000
IsoNet22.980.877019.110.885727.120.8191
DeepDeWedge23.170.882421.100.927828.750.8758
CryoGEN29.190.970632.690.994930.650.9199

数据取自 CryoGEN(ICLR 2025)Table 1。

说明

本页的图与表均取自已发表的 CryoGEN 论文 [1](见文末参考文献);CryoGEN-II 见参考文献 [2]。想自己把 .mrc 体渲染成这样的三维图,见软件与可视化教程

参考文献

  1. Yunfei Teng, Yuxuan Ren, Kai Chen, Xi Chen, Zhaoming Chen, Qiwei Ye. CryoGEN: Generative Energy-based Models for Cryogenic Electron Tomography Reconstruction. International Conference on Learning Representations (ICLR), 2025. openreview.net/forum?id=uOb7rij7sR
  2. Yunfei Teng 等. CryoGEN-II: Cryogenic Electron Tomography Reconstruction via Generative Network. CVPR 2026 Workshops(VISION). openaccess.thecvf.com

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